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क्रियात्मक समावयवता संरचनात्मक समावयवता होता है जिनके आणविक सूत्र समान होते हैं लेकिन परमाणु अलग-अलग तरीकों से जुड़े होते हैं ताकि उनमें उपस्थित क्रियात्मक समूह भिन्न हों।
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