प्रोटीन हॉर्मोन (Protein hormone) के अणु क्रमशः पेप्टाइड या प्रोटीन होते हैं। प्रोटीन हॉर्मोन रक्तप्रवाह में स्रावित पदार्थों का एक वर्ग जो अंगों और ऊतकों में प्रक्रियाओं को नियंत्रित करता है और इसमें अमीनो एसिड की लंबी-श्रृंखला बहुलक उपस्थित होती है।