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मीथेनोजन जीवाणु अवायवी श्वसन करने वाले जीवाणु है जो कार्बन डाई ऑक्साइड (CO<sub>2</sub>) तथा फॉर्मिक अम्ल से मीथेन गैस का निर्माण करते हैं। मीथेनोजन जीवाणु दलदल तथा पशुओं के रूमेन में पाये जाते हैं। उदाहरण #8211; मीथेनोबैक्टीरियम (Methanobacterium), मीथेनोकोकस (Methanococcus)।
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