प्रतिरक्षा तन्त्र (Immune System) जैविक प्रक्रियाओं का एक जाल हैं जो संक्रमण और विषाक्त पदार्थों का प्रतिरोध करता है। प्रतिरक्षा तन्त्र विभिन्न प्रकार के रोगजनकों का पता लगाता है और प्रतिक्रिया करता है एवं जो अंग प्रतिरक्षा में भाग लेते है उनके द्वारा ही प्रतिरक्षा तंत्र का निर्माण होता है।