फ्लोरीसेन्ट सूक्ष्मदर्शी को ऑप्टिकल सूक्ष्मदर्शी भी कहा जाता है। फ्लोरीसेन्ट सूक्ष्मदर्शी का उपयोग कार्बनिक या अकार्बनिक पदार्थों के गुणों के अध्ययन के लिए किया जाता है।